Onkogenetické soupravy pro NGS

EliGene® Adaptor-IL NGS
  • EliGene® Adaptor-IL NGS
  • EliGene® Adaptor-IL NGS
  • EliGene® Adaptor-IL NGS

EliGene® Adaptor-IL NGS

Účel použití

EliGene® Adaptor-IL NGS souprava je určena pro inkorporaci Molekulárních identifikátorů (MIDs) a specifických adaptorových sekvencí k PCR produktům amplifikovaným v multiplexové PCR cílových sekvencí v rámci EliGene® NGS kitů umožňujících detekci polymorfismů v rámci amplifikovaných cílových oblastí.

Úvod

Pomocí EliGene® NGS kitů dochází v jedné nebo více multiplexových PCR k amplifikaci cílových oblastí z jednoho vzorku. K amplifikaci je využit ready-to-use mastermix obsahující hot-start DNA polymerázu. Výsledné amplikony jsou následně 100x zředěny. V následné PCR reakci za použití EliGene® Adaptor-IL NGS soupravy jsou ke všem amplikonům z prví PCR přidány MID sekvence společně s p7 a p5 adaptory nutnými pro sekvenaci na sekvenátoru MiSeq (Illumina). Výsledné amplikony z jednoho vzorku jsou následně smíchány dohromady dle daného postupu, přečištěny od sekvencí kratších 150 bp a kvantifikovány pomocí Real-Time PCR za využití standardů. Takto přečištěné a označené amplikony jednotlivých vzorků jsou následně ve stejném poměru smíchány dohromady za vzniku výsledné směsi amplikonů pro sekvenční reakci. Sekvenační reakce je poté provedena na přístroji MiSeq (Illumina) dle návodu výrobce za použití specifických sekvenačních primerů z EliGene® Adaptor-IL NGS soupravy. V rámci sekvenčního běhu je provedena můstková PCR pro vytvoření jednotlivých klastrů, na kterých jsou prováděná jednotlivá sekvenační čtení.

Princip metody

EliGene® NGS kity umožňují multiplexovou PCR požadovaných cílových oblastí v rámci analyzovaných genů. Doporučené množství vstupní DNA do této multiplexové reakce je mezi 20-100 ng DNA získané izolací z formalinem fixovaných parafinových bločků (FFPE) nebo krve. Následně jsou takto získané amplikony z jednotlivých vzorků označeny MID sekvencemi a smíchány dohromady. Takto připravený vzorek je následně kvantifikován a sekvenován pomocí NGS přístroje Illumina umožňující multi-paralelní sekvenaci (MPS) dle návodu výrobce. Výsledné sekvence jsou následně srovnány s referenčními sekvencemi jednotlivých analyzovaných genů pro identifikaci polymorfismů.

CE IVD

Položky Kat. č. Balení Cena bez DPH DPH  
(CE) 90069-NGS 96 reakcí na vyžádání 21 %

Návod k použití 90069NGS-08122016 CZ

(publikováno 08.12.2016, velikost 843.1 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS Adaptor-IL Mix CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.5 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS p701 MID Primer CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.8 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS p702 MID Primer CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.7 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS p703 MID Primer CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.7 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS p704 MID Primer CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.8 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS p705 MID Primer CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.8 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS p706 MID Primer CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.5 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS p707 MID Primer CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.9 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS p708 MID Primer CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.5 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS p501 MID Primer CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.5 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS p502 MID Primer CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.8 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS p503 MID Primer CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.6 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS p504 MID Primer CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.7 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS p505 MID Primer EN

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.6 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS p506 MID Primer CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.6 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS RP1 Primer CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.2 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS RP2 Primer CZ

(publikováno 23.07.2018, velikost 543.3 kB)

MSDS EliGene Adaptor-IL NGS Index CZ

(publikováno 24.07.2018, velikost 543.2 kB)

Může vás ještě zajímat

Rukavice

Běžné vyšetřovací rukavice

Sterilní rukavice

Speciální rukavice (chemo)